消化系统疾病主要可以分为以下几类：

1.先天性疾病和遗传性疾病。

本系统的先天性疾病多属畸形，即各脏器的粗细、数目、形态及位置的异常、如有的人有两条食管；有的人结肠明显粗，以致蓄便很多，多天有一次大便；有的人肝脏在左侧，有的人肝内有或多或少的囊肿，常见的遗传性疾病如小肠息肉合并皮肤粘膜色素斑（黑斑息肉综合征），组织异位（如胃粘膜发生在肠粘膜、胰腺组织发生在胃粘膜上）。这些疾病多数不影响身体健康，但少数（如锁肛）也要进行手术治疗。

2.传染病。

最常见的消化系统传染性疾病是细菌性痢疾和胃肠炎，夏季尤为多见，细菌引起的急性化脓性胃炎非常少见，细菌还能侵犯胆道和肝而形成肝脓肿及胆道感染；其次是病毒引起的肠炎。因为病毒难以查出，所以确诊比较困难，肝炎也是病毒传染的，有甲、乙、丙、丁及戊型，目前认为以乙型最多。此外，还有一些全身性病毒病，如传染性单核细胞增多症也可侵犯肝脏引起肝炎。消化道寄生虫病也占很大比重，如蛔虫、蛲虫、钩虫、鞭毛虫、绦虫、姜片虫、线虫、阿米巴、吸虫等引起的疾病，以蛔虫病、蛲虫病最多见。
　　酵母菌属真菌，一般情况不引起疾病。但在年老体弱者，长期应用抗癌药或肾上腺皮质激素治疗的病人，易患真菌感染而产生的口炎、胃炎、肠炎及胆道炎等。

3.炎症性疾病。

炎症性疾病指的是原因不明的一些炎症如慢性胃炎，局限性肠炎也称克罗恩氏病，病变多在小肠末端，溃疡性结肠炎自直肠发病，逐渐向上蔓延，多形成溃疡，长期慢性腹泻，病人衰弱无力，服药无效时只能手术切除结肠，欧美各国比较多见。

4.消化性溃疡。

5.肿瘤。消化系统各个部位均可发生肿瘤，肿瘤有良性肿瘤和恶性肿瘤两类：

良性肿瘤，有如纤维瘤、脂肪瘤、肌瘤、良性息肉等。除息肉在肠中多见外，其他均属少见，良性肿瘤多局限在一处（脂肪瘤例外），有包膜，与正常组织有明确界限，不向他处转移，肿瘤较小时病人无感觉；肿大到一定程度压迫血管或神经时可以出现症状。

恶性肿瘤，有如癌、肉瘤及恶性淋巴瘤，其中以癌最为多见，与良性肿瘤相反，它与正常组织之间无明显界限，无包膜，可以转移到附近或全身各组织，常见于食管和胃。中国大肠癌的发病率比欧、美国家低，无明显的地区性，以上恶性肿瘤若定期作胃镜或肠镜检查，均能早期诊断。

6.结石病。

消化管内结石较少见，偶尔可见胃结石，多因吃柿子或黑枣引起，也有因吃甘薯及香蕉引起。胆总管，胆囊甚至肝内胆管结石最为常见。在西方国家常见于肥胖女性，以胆固醇结石为主；而在中国多系感染后的混合结石，成为以胆色素及钙盐为主。胆囊结石数目可以很多，由数十块至数百块，若不堵塞胆管，病人无感觉，一旦堵塞胆管，胆汁流通不畅，病人即出现黄疸，并发生剧烈右上腹绞痛，同时发冷发烧，必要时需行手术治疗。

7.消化道功能异常性疾病。

消化道各部分的组织（如肌肉 粘膜等）并无损伤，但其功能不正常，食管发生痉挛时，病人感到胸骨后剧痛，同时有咽下困难，胃痉挛时可以反复呕吐或厌食，结肠功能不正常时 病人排便次数增多。一日数次，相反也可以便秘，数日排便一次，这类疾病一般无生命危险。但需要作一套周密的检查，方可作出诊断，治疗也不容易。

来源：好大夫在线