原因在于：这是一种新型病毒。流感病毒一直在发生变异，主要是表面蛋白质出现的细小变化。通常情况下，这一年的流感病毒与你上一次感染的任何病毒之间存在很多差异，这些差异允许新病毒绕过免疫系统，致使发生感染；新病毒与上一次感染病毒间的类似之处则意味着，你仍有部分免疫能力。

流感病毒表面蛋白质分为16个不同的种类，病毒之间异种“交配”同时交换基因。通常情况下，一种新型流感病毒拥有全新的表面蛋白质，这些蛋白质来自猪或者禽流感病毒，并在人类中间传播。在此之前，还没有人感染这种猪流感病毒的病例出现，因此，也就没有人拥有任何免疫力，为病毒的流行提供了环境。

墨西哥爆发的猪流感就是这种情况。这种流感病毒是H1N1家族的一员，H1和N1分别代表两种主要表面蛋白质。除墨西哥的猪流感病毒外，H1N1家族还有其它较为“温和”的成员，能够像普通流感病毒一样在人中间传播。猪的H1蛋白质与其它蛋白质不同，目前尚不清楚人型H1N1流感患者是否能够对这种猪流感病毒产生免疫力。

1918年爆发的流感是由一种H1N1病毒所致，有证据显示早期人型H1病毒感染者对其拥有免疫力。

1918年的病毒与现在的病毒不同，原因在于：其H表面蛋白质来自鸟类。