2020年1月（2020年1月1日0时至1月31日24时），全国（不含香港、澳门特别行政区和台湾地区，下同）共报告法定传染病1414630例，死亡1629人。其中，甲类传染病无发病报告，鼠疫报告1例死亡。乙类传染病中传染性非典型肺炎、脊髓灰质炎、人感染高致病性禽流感、白喉和人感染H7N9禽流感无发病、死亡报告，其余22种乙类传染病共报告发病257376例，死亡1514人。报告发病数居前5位的病种依次为病毒性肝炎、肺结核、梅毒、新型冠状病毒肺炎以及淋病，占乙类传染病报告病例总数的93%。

2020年1月20日，国家卫生健康委发布公告，将新型冠状病毒肺炎纳入乙类传染病并按照甲类传染病管理，截至1月31日24时，全国累计报告确诊病例11791例，死亡259人。

同期，丙类传染病中丝虫病无发病、死亡报告，其余10种丙类传染病共报告发病1157254例，死亡114人。报告发病数居前3位的病种依次为流行性感冒、其他感染性腹泻病和手足口病，占丙类传染病报告病例总数的98％。冬春季是流行性感冒等呼吸道传染病的高发季节，自2019年12月份以来全国各省份陆续进入流行性感冒冬季流行季，流行性感冒活动水平不断上升，并相继达到流行高峰期，导致丙类传染病发病和报告以流行性感冒为主。目前，全国流行性感冒活动水平已经回落，预计未来一段时间，流行性感冒活动水平将进一步回落。