此次的猪流感病毒代号为H1N1亚型猪流感病毒新毒株，它包含人流感病毒、北美禽流感病毒和北美、欧洲、亚洲三类猪流感病毒的基因片段。
虽然世界卫生组织曾经发现过混合了人、禽和猪三种流感病毒的毒株，但从未见过这种跨洲组合的猪流感病毒。
世界卫生组织证实，一些病例是由前所未见的新型H1N1流感病毒引起的。H1N1与通常引起人类流感季节性暴发的病毒类型相同。但新型H1N1病毒又有所不同：它含有一种遗传物质，这种遗传物质通常在感染人类、鸟类和猪的病毒中发现。流感病毒可以相互之间传播遗传物质，新型H1N1 病毒似乎是由这种病毒的不同类型在同一种动物寄主身上混合形成的，通常会传染不同的物种。
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