据科克伦研究人员最新系统审查表明，奎宁将不再是治疗重症疟疾的首选用药。目前研究证明源于中药药材的抗疟药物青蒿琥酯，用于预防重症疟疾患者死亡更有效。

当疟疾影响重要器官功能时则为重症疟疾。罕见的脑型疟疾与其相关联，它可影响大脑并导致长期残疾。每年超过百万人死于重症疟疾，大多数在撒哈拉以南非洲。2006年世界卫生组织（WHO）推荐青蒿琥酯作为成人重症疟疾的首选治疗选择，但是对奎宁作为儿童疟疾的标准治疗，当时建议其作出改变的证据不足。

研究人员对青蒿琥酯的回顾性分析进行了更新，在现有的8个临床试验中又加入了新的大型多中心非洲儿童试验，该研究于2010年发表于《柳叶刀》。目前该分析共包含了来自非洲和亚洲的1664名成人和5765名儿童。根据研究结果，与奎宁相比，青蒿琥酯能够使成年人死亡风险降低39％，儿童则降低24％。在成人中，奎宁和青蒿琥酯分别减少重症疟疾所导致的死亡人数为：241 /1000人，147/1000人。在儿童中，奎宁和青蒿琥酯减少的死亡人数为：108/1000人，83/1000人。

WHO全球疟疾项目Peter Olumese说，现在有足够的证据让我们确信成人和儿童中的这些结果，目前世界各地正将推荐静脉注射青蒿琥酯为成人和儿童重症疟疾的首选治疗。

与接受奎宁的儿童相比，有更多的接受青蒿琥酯儿童遭受神经系统问题，但在一个月之内的治疗中这些问题的大部分均可解决，与其增加的存活率相比，利大于弊。英国利物浦热带医学院领导该研究小组的David Sinclair说，权衡风险获益比后支持青蒿琥酯用于治疗重症疟疾。