最近，中国研究人员完成了世界上首个药用植物基因组框架图——丹参基因组框架图，推动丹参成为第一个“模式药用植物”

丹参是著名药用植物，在中国境内广为种植。丹参基因组的完成，表明人们可以从基因上充分认识丹参、利用丹参。

中国医学科学院药用植物研究所等研究人员，利用第二代高通量测序技术对丹参全基因组进行测序，并完成丹参基因组框架图的组装。目前测序深度已达丹参基因组大小的20倍，测序结果已覆盖92%的丹参全基因组和96%的基因编码区。

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丹参的活性物质分为两大类：一类为脂溶性的丹参酮类化合物，包括丹参酮Ⅰ和丹参酮ⅡA等；另一类为水溶性的酚酸类物质，包括迷迭香酸、丹酚酸、紫草酸以及丹参素等。由于传统中医是用水煎服用，各种药物中的水溶性成分的药理活性受到广泛重视，丹参也不例外，丹参的水溶性酚酸类物质也成为目前研究的热点。

研究发现，苯丙烷类代谢途径的中间产物如咖啡酸等参与丹参水溶性物质的合成。而苯丙烷类代谢途径的第一个关键酶是苯丙氨酸解氨酶(PAL)。目前已经有研究人员克隆了这一基因，并发现了苯丙氨酸解氨酶基因与丹参生长发育及次生代谢物合成之间的一些关系，也逐渐明了丹参主要水溶性成分合成的某种分子机理。

还有研究人员发现了丹参生长的某些奥秘，例如，发现并克隆了丹参的SmGRP1基因。该基因与钙离子一起参与丹参的调节气孔运动，从而让丹参可以抵御外界不良环境。