药品维生素一般成分单一，是工业提成品，作为药品，国家有明确限价；而保健品维生素一般还有矿物质等其他添加成分，且通常是天然维生素提取物（这也是商家宣传的重点），作为食品，没有严格的限价，同时厂家需要大量的宣传费用。这些都是导致两者价格悬殊的原因。
药品用于疾病的治疗和预防，其生产和配方要经过国家有关部门审查，并通过药理、病理和毒理试验及大量的临床验证，有严格适应证，通过国家药品食品监督管理局审查批准后，方可投入市场。而保健品可以在食品厂生产，仅仅检验污染物、细菌等卫生指标，不需经过临床试验等便可投入市场，没有治疗作用，只起保健作用。
两者属于不同范畴，其效果不能简单比较。一般人群如果没有明显的缺乏症，选用复合制剂的保健品维生素比较合适；而一旦患有维生素缺乏病，则需在医生指导下补充维生素药品。
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