到目前为止，研究和应用最多的5-HT4激动剂是苯甲酰胺类的西沙必利（cisapride）、莫沙比利(mosapride)及普卡比利（prucalopride），这类药物的作用强度、药效和选择性尚有一定缺陷（比如与5-HT3、5-HT2、多巴胺和其他单胺受体有较强的结合力,可引发其他系统的不良反应），使其在临床的应用受到一定限制。

西沙必利除对5-HT4受体有激动作用外，对5-HT3受体的拮抗作用不确切，对胃肠道，特别是结肠运动的作用相对较弱(5-HT对结肠调节作用可由5-HT3受体和5-HT4受体独立或联合介导)，因此对便秘的疗效并不完全确定 ；另外因会引起Q-T间期延长，导致心律紊乱等不良反应,西沙比利的制造商美国杨森公司2000年7月已经宣布停止该药在美国的推广 。

与西沙比利相比，莫沙比利及普卡比利则具有较多的优势，迄今尚未发现对心脏的不良反应，不会导致QT间期延长及无多巴胺D2拮抗剂活性，对胃肠道的作用也较确切，故在临床上得到了广泛的应用。一项评价普卡比利对胃肠道和结肠转运时间作用的临床分组对照试验显示：在用药后4、8、24和48小时，总的结肠通过时间和近端结肠T1/2排空明显加快(P<0.05)。0.5、2、4m三组相比加速结肠通过时间几乎相等，且对胃排空(P>0.05)和小肠通过时间(P=0.12)几无影响。健康受试者即使连用7天仍具有良好的耐受性。结论认为，普卡比利可以选择性地加速结肠转运功能，部分是通过刺激近端结肠的排空而发挥作用 。

最新的研究显示吲哚烷胺类是目前最具强力作用和更高选择性的一类5-HT4激动剂 , ，这类药品刚刚面世，目前还没有进入中国市场，其代表性产品为马来酸氢5-甲氧基-吲哚-3-羧基脱氢氨亚甲基腙（5-methoxy-indole-3-carboxaldehyde amino (penthylamino) methylene hydrazone hydrogen maleate， SDZ HTF-919,简称HTF）。

HTF是一种强效5-HT4受体激动剂，试验中通过电刺激豚鼠回肠纵形肌条发现，HTF的作用强度是其他5-HT受体激动剂的20-500倍12。在选择性方面，除对5-HT1A受体有中等度亲和力外，与其他受体仅显示弱的亲和力，因此HTF是一种特异性的5-HT4受体激动剂。另外，由于此药极性的增加，消除了因穿透血脑屏障而致的中枢神经系统的不良反应。在临床治疗剂量的范围内，对大鼠离体心脏模型的Q-T间期无任何影响 ，无疑确定了HTF是一种安全而有效的治疗功能性胃肠疾病药物。　　

动物研究显示了HTF对全胃肠道运动功能的刺激作用。它可刺激鼠的胃排空，使小鼠减弱的结肠通过功能恢复正常。健康人口服各种剂量的HTF后均产生轻--中度胃肠反应，主要是粪便松软，反应了HTF的药理学作用特征。HTF可使人体基础全结肠运送时间（TCTT）缩短，与安慰剂组相比有显著差异，但HTF的药效学作用无明显剂量效应关系 。作者还研究了HTF对健康人模拟的慢结肠输送模型的作用，模拟的慢结肠输送模型使TCTT由生理状况下的30-34小时延长至59-89小时，服用HTF后TCTT缩短至22小时；但本研究中作者发现HTF仅在每日两次5mg的剂量时TCTT缩短显著，提示HTF对TCTT具有双相的剂量效应关系 。Appel等发现，随着HTF用药剂量的加大，头痛的发生率有所增加。其原因可能是因大脑的许多功能直接与5-HT4受体有关，或HTF有可能通过使迷走通路激活而间接激动5-HT4受体。此外，还有作者报道HTF可应用于以便秘为主要症状的IBS治疗，效果良好 、 。