（一）血常规。普通病例白细胞计数正常，重症病例白细胞计数可明显升高。
（二）血生化检查。部分病例可有轻度ALT、AST、CK-MB升高，重症病例可有肌钙蛋白（cTnⅠ）、血糖升高。CRP一般不升高。
（三）脑脊液检查。神经系统受累时可有以下异常：外观清亮，压力增高，白细胞增多（危重病例多核细胞可多于单核细胞），蛋白正常或轻度增多，糖和氯化物正常。
（四）病原学检查。肠道病毒（CoxA16、EV71等）特异性核酸阳性或分离到肠道病毒。咽、气道分泌物、疱疹液、粪便阳性率较高。应及时规范留取标本，并尽快送检。
（五）血清学检查。急性期与恢复期血清EV71、CoxA16或其他肠道病毒中和抗体有4倍以上的升高。
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