1、2、2　参与代谢的3个重要铁硫蛋白　PFOR、铁氧化还原蛋白( ferredoxin ) 以及氢化酶( hydrogenase)是呼吸链中3类最主要的铁硫蛋白,在原生生物或者高等生物体内,它们的存在形式以及功能都有所不同^{[ 16 ]} 。

多数真核生物的PFOR为分子质量达200 000～300 000的二聚体,含有2个[ 4Fe-4S ]中心,而上述3种“无线粒体”原生生物的PFOR的分子质量以及结构与其十分相似, 分子质量约为240 000 ～280 000,并含有2个[ 4Fe-4S ]簇,但是, PFOR在细胞内的定位却十分不相同。多数细菌以及真菌的PFOR 存在于胞质中,而阴道毛滴虫的PFOR 存在于氢化酶体中,并与氢化酶体的膜结构交联。在一级结构水平上,阴道毛滴虫中PFOR的氨基端拥有拟线粒体靶向肽的序列(putative mitochondrial targeting pep tide) ^{[ 16 ]} ;功能上,它参与丙酮酸盐的代谢。同时,也有研究表明肠贾第虫以及溶组织内阿米巴源的PFOR也与质膜存在结构交联,但是它们的一级结构中都没有拟线粒体靶向肽的序列,其生理意义还有待于进一步研究。

铁氧化还原蛋白是另一个重要的含Fe-S簇蛋白,上述3种原生动物的铁氧化还原蛋白中所含Fe-S簇数目以及细胞内定位都不尽相同。溶组织内阿米巴基因至少编码3种铁氧化还原蛋白,它们分别含有2个[ 4Fe-4S]簇、1个[ 4Fe-4S]簇和1个[ 3Fe-4S]簇^{[ 12 ]}198, 199。肠贾第虫基因组至少编码4种铁氧化还原蛋白,其中1种包含1个[ 2Fe-2S ]簇( ferredoxin I) , 另外3种包含1或者2个[ 4Fe-4S]簇, 现有的研究仅仅分析出ferredoxin I有接受电子的功能[ 21 ] 。此外,溶组织阿米巴以及肠贾第虫分别含有1和2个编码铁氧化还原蛋白硝基还原酶( ferredoxin nitroreductase)的基因,该酶与甲硝唑的作用位点有关。阴道毛滴虫的铁氧化还原蛋白含有1 个[ 2Fe-2S]簇,且其氨基端有一个含8个氨基酸的拟线粒体靶向序列^{[ 22 ]} 。铁氧化还原蛋白在阴道毛滴虫中定位于氢化酶体,而在其他两种寄生虫体内则存在于胞质中。

氢化酶是对氧敏感的酶类,主要存在于厌氧菌以及某些原生寄生虫的氢化酶体中,主要功能是转移电子到质子以产生氢。现在确认的氢化酶有2种类型,分别为异二聚体镍铁-氢化酶以及单体铁-氢化酶。阴道毛滴虫含有至少3个铁-氢化酶基因,其编码的酶分为“短型”和“长型”两种类型,其中长型氢化酶的活性主要为接受来自铁氧化还原蛋白的电子^{[ 23 ]} 。在肠贾第虫以及溶组织内阿米巴的基因组中同样鉴定出编码氢化酶的基因,但是肠贾第虫的氢化酶产氢速率只有阴道毛滴虫的约1 /10^{[ 20 ]} ,这两种原生虫的氢化酶生理意义还不十分清楚。